El corazón de la Biblioteca Nacional son sus depósitos o almacenes. En ellos se conservan los documentos, libros y revistas que usuarios e investigadores consultan en los salones de lectura. El edificio, aparentemente de cuatro pisos, cuenta con 8 niveles de almacenes en su interior, los que son de acceso restringido para el público. En el depósito de la sección Fondo General, por ejemplo, se resguardan escritos extranjeros e iberoamericanos. La colección suma más de trescientos cincuenta mil títulos.

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