El origen de este museo data desde el 25 de abril del año 1990, cuando se organiza la primera colección por iniciativa de Carabineros de Chile y con la valiosa colaboración de los vecinos de Puerto Natales. El mismo año de su creación queda bajo la tuición de la Ilustre Municipalidad de Natales, entidad que se encarga de conservar y aumentar la muestra museográfica y poner en conocimiento del pueblo local nacional y extranjero la historia y cultura de la zona de la última esperanza.